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通常情况下，基因、大脑、躯体都能够圆满地合作，毕竟三者是共存共荣的。但随着人脑的不断进化，大脑开始形成了自主意识，开始追求自己的生存乐趣和欲求，不理会或忽略了基因的生存目的。例如，基因只寻求有助于复制自己的材料，大脑却追求满足自己物欲的财富；基因操纵躯体进行复制自己的繁殖行为，大脑却指挥躯体进行与复制自己无关的享乐。
在人际关系上，基因认同的重要性每况愈下，而大脑认同的重要性却正相反。“酒逢知己千杯少，话不投机半句多。”恰是一种典型的大脑认同。有血缘关系的人之间，基因认同的力量已不足以阻止他们同类相残——为了政治、宗教、金钱、性情，家庭内部以及家族内部多反目成仇，大打出手。而没有血缘关系的人，却可以为了某种共同利益而亲密相处。
大脑认同是一种非常复杂的机制，它有时候与基因认同密切相关，例如“老乡意识”；有时则与基因认同无关，例如惺惺相惜，一见如故。复杂的大脑思维很难找到或遇上另一个可以彼此完全认同的大脑，这种现象即俗话说的“人生得一知己足矣”。
大脑结构的复杂性远远超过了基因，结构越复杂，相互认同越困难。此外，基因的结构和储存的信息比较稳定，而稳定的结构则容易认同，大脑的结构及其储存的信息却始终处于变化之中，故难以认同或认同之后仍可能出现反复（例如不讲信用，违背诺言）。
目前，人类成员已在“人”这个层次上完成了基因认同——承认彼此都是人属于同类，享有同类之间的平等权利（种族歧视的实质就是基因不认同或不完全认同）。但是，大脑认同则远远没有完成，还只是刚刚开始；由于普遍存在着大脑不认同现象，因此人类成员彼此相疑相戒、相害相残，可以说绝大多数人祸都源于大脑不认同。
——四维通慧·刘宏毅